Estamos buscando candidatos para solicitar un contrato predoctoral para realizar una Tesis Doctoral enmarcada en el proyecto que se indica más adelante. La convocatoria saldrá a finales de Agosto, y la presentación de solicitudes se cerrará el 10 de Septiembre (ver BOE correspondiente en el enlace http://www.boe.es/boe/dias/2013/08/14/pdfs/BOE-A-2013-8984.pdf). Es necesario haber terminado, o estar finalizando, un Master Universitario (leer convocatoria para los requisitos necesarios). Las personas interesadas, con licenciatura de Biología, Química o Farmacia y preferentemente con expediente igual o superior a 2, contactar por e-mail con Fernando Rojo (e-mail: frojo@cnb.csic.es <mailto:frojo@cnb.csic.es>). *TITULO DEL PROYECTO*: El sistema regulador formado por la proteína Crc y los sRNAs CrcZ y CrcY de /Pseudomonas putida/: nuevas funciones y control de CrcZ y CrcY *Referencia del proyecto*: BFU2012-32797 *INVESTIGADOR PRINCIPAL: *Fernando Rojo de Castro** *RESUMEN*: /Pseudomonas putida/ es una bacteria ubicua, metabólicamente muy versátil, y muy utilizada como modelo experimental y en biotecnología. Para entender su biología y para optimizar aplicaciones biotecnológicas basadas en esta bacteria, es importante conocer la redes de regulación global que coordinan la expresión de su genoma, y entender los mecanismos moleculares por los que funcionan estas redes. El objetivo de este proyecto es estudiar nuevos aspectos del sistema regulador formado por la proteína Crc y los RNAs pequeños (sRNAs) CrcZ y CrcY, responsable de una de estas redes de regulación, y entender cómo se controla su actividad. La proteína Crc es un regulador global que coordina y optimiza el metabolismo en las bacterias del género Pseudomonas, y tiene una función importante en el proceso de represión catabólica. Recientemente hemos demostrado que Crc actúa uniéndose a una diana presente en determinados mRNAs, inhibiendo su traducción. Datos recientes sugieren que, además de optimizar la asimilación de fuentes de carbono, Crc participa en otros procesos, coordinando diferentes aspectos de la fisiología de la bacteria. En este proyecto analizaremos la función de la proteína Crc en procesos que no se habían relacionado antes con este regulador, como la respuesta SOS o la síntesis de polihidroxialcanoatos (PHAs). Los PHAs son polímeros que la bacteria produce como sistema de reserva de carbono y energía, y para adaptar el flujo de carbono a la demanda de intermediarios metabólicos. Tienen propiedades similares a los plásticos y son biodegradables, lo que les da un gran interés biotecnológico. En /P. putida/,//la actividad de Crc está controlada por dos sRNAs llamados CrcZ y CrcY que pueden unirse a Crc y secuestrarla cuando su función no es necesaria. Por lo tanto, estos sRNAs actúan como antagonistas de Crc. Hemos observado que los niveles de CrcZ y CrcY varían fuertemente en función de señales fisiológicas y medioambientales, pero no se sabe cuál es el mecanismo responsable de estos cambios. Pretendemos averiguar si los niveles de CrcZ y CrcY se controlan regulando su transcripción, su degradación, o ambas cosas. También buscaremos los factores responsables de esta regulación. Los sRNAs han adquirido un protagonismo creciente y parece claro que tienen una función esencial en la regulación global de la expresión génica en bacterias, en especial para modular respuestas rápidas a cambios fisiológicos o medioambientales.
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viernes, 23 de agosto de 2013
Se buscan candidatos para solicitar un contrato predoctoral
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